تستخدم مناظير الجهاز الهضمي في العديد من الأغراض التشخيصية والعلاجية للكثير من الأمراض، حيث يستخدمها الأطباء لفحص القناة الهضمية والتعرف على المشاكل الموجودة داخل الجسم بدون جراحة.
ويمكن استخدام بعض الآلات التي تدخل في القناة الجانبية للمنظار لأخذ عينات أو إستئصال زوائد لحمية وآلات أخرى لإيقاف النزيف الداخلي.